Utgangspunktet for Compaqs Linux-engasjement er arven fra Digital. Linux-gründer Linus Torvalds fikk sin første Alpha-arbeidsstasjon i 1994. Året etter hadde han gjort ferdig den første 64 biters RISC-utgaven av Linux. Det samme året meldte Digital seg inn i Linux International som den første systemleverandøren.
Alpha-tjenerne AlphaServer 800 og AlphaServer DS20 ble Linux-sertifisert tidligere i år. Den samme sertifiseringen er nå gitt ProLiant 1850R og ProLiant 1600. Torvalds fikk nylig levert en DS20, som han skal bruke for videre utviklingsarbeid på Linux.
Den første Alpha-arbeidsstasjonen, XP1000, er også gjort Linux-tilgjengelig. Compaq sier at man planlegger å gjøre det samme for utvalgte Intel-baserte arbeidsstasjoner. XP1000 betegnes som verdens raskeste arbeidsstasjon. Den drives av en Alpha 21264-prosessor i 500 MHz.
Kombinasjonen av Linux og Alpha er allerede grunnlaget for superdatamaskinen Avalon i USAs nasjonale atom-laboratorium Los Alamos. Ett nytt bibliotek, kalt Compaq Portable Math Library (CPML) for Alpha-Linux, lover å gjøre beregninger opptil ti ganger få fort, samtidig med at presisjonen blir økt tilsvarende. Compaq lover at en betaversjon av CPML skal legges ut på http://www.unix.digital.com/linux/cpml.htm fra 15. mars.
